Tout importateur des médicaments à usage humain doit avoir une autorisation signée par le Ministre en charge de la santé publique après avis de l'autorité de régulation. Seuls les médicaments et autres produits pharmaceutiques régulièrement homologués au Burundi et répondant aux spécifications qui leur sont applicables peuvent être autorisés à l'importation.

Toute importation de biens dont la valeur FOB est égale ou excède 3000 USD pour les produits chimiques, alimentaires et pharmaceutiques, et de ceux dont la valeur FOB est supérieure ou égale à 5000 USD pour les autres produits, y compris les dons, doit matérialiser son intention d'importer en remplissant une déclaration d'intention d'importer auprès de sa banque. Un numéro d'ordre valide lui permettant d'identifier sa déclaration d'intention d'importer lui est attribué. La période de validité d’une déclaration d’importation est de 6 mois renouvelable une fois.

Le contrat de transport de marchandises est défini comme étant celui par lequel le transporteur s'engage principalement et moyennant rémunération, à déplacer, d'un lieu à un autre, la marchandise qui lui est remise par l'expéditeur.